玉龙雪山自然保护区,野生植物有3800多种,其中藻类植物有31科72属196种,地衣植物有17科14属20多种,苔藓植物有175种,蕨类植物有220种,种子植物有145科758属3200种。横断山脉是世界上山地植物区系最丰富的地区,而玉龙山是横断山脉中高山植物区系最集中的地区。这里还是山地植物垂直带谱保存最完整的地区之一。由于山体较高,从河谷到山顶出现从中亚热带到寒温带完整的植被自然气候垂直带谱。