森林分布多呈片状散布，有明显的坡向性，有：温带落叶阔叶林，分布于东部的大通河下游、湟水谷地海拔2100－2900米的山地阴坡、半阴坡及沟谷地带。建群种主要有山杨、白桦、红桦等。可与油松、青杄（海拔2300－2600）、青海云杉（海拔2600－2900）形成针阔叶林混交林。温带常绿针叶林，主要分布于东部地区的连城及互助北山一带海拔2000－2600米的山地阴坡或半阴坡。以油松为群落建群种，有时有山杨、白桦等混生。寒温带针叶林，广泛分布于祁连山东部地区海拔2500－3200米的山地阴坡，西至北大河，集中于祁连山北坡的肃南、天祝、张掖、武威、山丹和中部的祁连、大通河地区及湟水谷地等地。林木类型以青海支杉为主要建群种。多以纯林状态存在。青杄林分布于大通河下游地区海拔2000－2700米的土地阴坡。介于油松林与青海云杉要之间。此外，大通河谷地、祁连等地海拔2300－3500米的山地半阴坡或阴坡还分布有适应半干旱、寒冷气候的祁连圆柏林。
